hu.MAP 3.0: Complex View
Human Protein Complex Map
Search for a protein
Complex: huMAP3_00858.1
Complex Portal: CPX-20883
Confidence: Extremely High
Proteins| Genename | Protein Name | Uniprot Annotation Score | Links |
|---|---|---|---|
| COL13A1 | Collagen alpha-1(XIII) chain (COLXIIIA1) | 5 | UniProt NCBI |
| COLGALT2 | Procollagen galactosyltransferase 2 (EC 2.4.1.50) (Collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2) (ColGalT 2) (Glycosyltransferase 25 family member 2) (Hydroxylysine galactosyltransferase 2) | 5 | UniProt NCBI |
| DOK1 | Docking protein 1 (Downstream of tyrosine kinase 1) (p62(dok)) (pp62) | 5 | UniProt NCBI |
| COL9A2 | Collagen alpha-2(IX) chain | 5 | UniProt NCBI |
| COL4A2 | Collagen alpha-2(IV) chain [Cleaved into: Canstatin] | 5 | UniProt NCBI |
| COL9A3 | Collagen alpha-3(IX) chain | 5 | UniProt NCBI |
Enrichments
| Term ID | Corrected Pval | Fraction Complex Coverage | Proteins | Term Name |
|---|---|---|---|---|
| REAC:R-HSA-1650814 | 5.14837835227e-10 | 0.833333333333 | COL13A1 COL4A2 COLGALT2 COL9A3 COL9A2 | Collagen biosynthesis and modifying enzymes |
| REAC:R-HSA-1474290 | 2.76846766863e-09 | 0.833333333333 | COL13A1 COL4A2 COLGALT2 COL9A3 COL9A2 | Collagen formation |
| REAC:R-HSA-8948216 | 3.96532736613e-08 | 0.666666666667 | COL13A1 COL9A2 COL9A3 COL4A2 | Collagen chain trimerization |
| REAC:R-HSA-1442490 | 3.05932552684e-07 | 0.666666666667 | COL13A1 COL9A2 COL9A3 COL4A2 | Collagen degradation |
| KEGG:04974 | 3.50709282732e-07 | 0.666666666667 | COL13A1 COL9A2 COL9A3 COL4A2 | Protein digestion and absorption |
| REAC:R-HSA-216083 | 8.58772945408e-07 | 0.666666666667 | COL13A1 COL9A2 COL9A3 COL4A2 | Integrin cell surface interactions |
| REAC:R-HSA-1474244 | 9.63375583697e-07 | 0.833333333333 | COL13A1 COL4A2 COLGALT2 COL9A3 COL9A2 | Extracellular matrix organization |
| GO:0005581 | 3.48770721675e-06 | 0.666666666667 | COL13A1 COL9A2 COL9A3 COL4A2 | collagen trimer |
| REAC:R-HSA-1474228 | 6.85992153937e-06 | 0.666666666667 | COL13A1 COL9A2 COL9A3 COL4A2 | Degradation of the extracellular matrix |
| GO:0030020 | 9.34862345773e-06 | 0.666666666667 | COL13A1 COL9A2 COL9A3 COL4A2 | extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength |
| REAC:R-HSA-419037 | 2.05965741212e-05 | 0.5 | COL4A2 COL9A2 COL9A3 | NCAM1 interactions |
| HPA:0200273 | 4.16308055378e-05 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | eye; hyaloid membrane[High] |
| GO:0030198 | 6.33048718711e-05 | 0.833333333333 | COL13A1 COL4A2 COLGALT2 COL9A3 COL9A2 | extracellular matrix organization |
| GO:0043062 | 6.33048718711e-05 | 0.833333333333 | COL13A1 COL4A2 COLGALT2 COL9A3 COL9A2 | extracellular structure organization |
| GO:0045229 | 6.71098822461e-05 | 0.833333333333 | COL13A1 COL4A2 COLGALT2 COL9A3 COL9A2 | external encapsulating structure organization |
| REAC:R-HSA-375165 | 8.06503831344e-05 | 0.5 | COL4A2 COL9A2 COL9A3 | NCAM signaling for neurite out-growth |
| HPA:0200271 | 8.32464165711e-05 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | eye; hyaloid membrane[>=Low] |
| HPA:0070113 | 8.32464165711e-05 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | cartilage; chondrocytes[High] |
| HPA:0200272 | 8.32464165711e-05 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | eye; hyaloid membrane[>=Medium] |
| KEGG:04512 | 9.43976951613e-05 | 0.5 | COL4A2 COL9A2 COL9A3 | ECM-receptor interaction |
| REAC:R-HSA-2022090 | 0.000113827315454 | 0.5 | COL4A2 COL9A2 COL9A3 | Assembly of collagen fibrils and other multimeric structures |
| REAC:R-HSA-186797 | 0.00012139707053 | 0.5 | COL4A2 COL9A2 COL9A3 | Signaling by PDGF |
| WP:WP4789 | 0.00015103053622 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | MED and pseudoachondroplasia genes |
| REAC:R-HSA-3000178 | 0.000216237937074 | 0.5 | COL4A2 COL9A2 COL9A3 | ECM proteoglycans |
| HPA:0070000 | 0.000291202964835 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | cartilage |
| HPA:0070111 | 0.000291202964835 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | cartilage; chondrocytes[>=Low] |
| HPA:0070112 | 0.000291202964835 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | cartilage; chondrocytes[>=Medium] |
| HP:0006190 | 0.000324079809263 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | Radially deviated wrists |
| HP:0003946 | 0.000324079809263 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | Abnormality of the epiphyses of the elbow |
| HP:0009189 | 0.000324079809263 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | Fragmentation of the metacarpal epiphyses |
| HP:0012770 | 0.000324079809263 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | Reduced arm span |
| HP:0003841 | 0.000324079809263 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | Fragmented epiphyses of the upper limbs |
| GO:0005788 | 0.000391906186706 | 0.833333333333 | COL13A1 COL4A2 COLGALT2 COL9A3 COL9A2 | endoplasmic reticulum lumen |
| HP:0006055 | 0.000648041335154 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | Ulnar deviated club hands |
| HP:0003999 | 0.00107987178333 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | Abnormality of radial epiphyses |
| HP:0100168 | 0.00107987178333 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | Fragmented epiphyses |
| HP:0010631 | 0.00161951205762 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | Abnormality of the epiphyses of the feet |
| KEGG:04510 | 0.00164389422478 | 0.5 | COL4A2 COL9A2 COL9A3 | Focal adhesion |
| GO:0005201 | 0.00260208750266 | 0.666666666667 | COL13A1 COL9A2 COL9A3 COL4A2 | extracellular matrix structural constituent |
| HPA:0200000 | 0.00290459637219 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | eye |
| HP:0012769 | 0.00302198579101 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | Abnormal arm span |
| HP:0003365 | 0.00302198579101 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | Arthralgia of the hip |
| REAC:R-HSA-422475 | 0.0030564769327 | 0.666666666667 | DOK1 COL9A2 COL9A3 COL4A2 | Axon guidance |
| REAC:R-HSA-9675108 | 0.00353370301704 | 0.666666666667 | DOK1 COL9A2 COL9A3 COL4A2 | Nervous system development |
| HP:0009486 | 0.00388470114881 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | Radial deviation of the hand |
| HP:0002515 | 0.00577679393552 | 0.5 | COL13A1 COL9A2 COL9A3 | Waddling gait |
| KEGG:04151 | 0.00734849685315 | 0.5 | COL4A2 COL9A2 COL9A3 | PI3K-Akt signaling pathway |
| KEGG:05165 | 0.00797489844932 | 0.5 | COL4A2 COL9A2 COL9A3 | Human papillomavirus infection |
| HP:0030973 | 0.00841070885474 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | Postexertional symptom exacerbation |
| HP:0030839 | 0.00841070885474 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | Knee pain |
| HP:0010665 | 0.00841070885474 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | Bilateral coxa valga |
| WP:WP4172 | 0.00867989635729 | 0.5 | COL4A2 COL9A2 COL9A3 | PI3K Akt signaling pathway |
| HP:0003546 | 0.00922220710687 | 0.5 | COL13A1 COL9A2 COL9A3 | Exercise intolerance |
| HP:0100694 | 0.0129324670968 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | Tibial torsion |
| HP:0005913 | 0.0146541203169 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | Abnormal metacarpal epiphysis morphology |
| HP:0007773 | 0.0164828756284 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | Vitreoretinopathy |
| HP:0010585 | 0.0164828756284 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | Small epiphyses |
| HP:0003502 | 0.0164828756284 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | Mild short stature |
| HP:0010582 | 0.0184186741717 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | Irregular epiphyses |
| GO:0005594 | 0.0210651876021 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | collagen type IX trimer |
| REAC:R-HSA-1266738 | 0.02903341132 | 0.666666666667 | DOK1 COL9A2 COL9A3 COL4A2 | Developmental Biology |
| HP:0002656 | 0.0297012565438 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | Epiphyseal dysplasia |
| HP:0003301 | 0.0322780794397 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | Irregular vertebral endplates |
| HP:0009487 | 0.0436511011886 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | Ulnar deviation of the hand |
| HP:0005106 | 0.0499762286031 | 0.333333333333 | COL9A3 COL9A2 | Abnormality of the vertebral endplates |
Edges
| Protein 1 | Protein 2 | Score | ProteomeHD | Interface Overlap | Evidence |
|---|---|---|---|---|---|
| COL13A1 | COLGALT2 | 0.994 | bioplex_WMM bioplex3_WMM bioplex3_HCT116 WMM_only | ||
| COLGALT2 | COL9A3 | 0.988 | bioplex3_WMM bioplex3_HCT116 WMM_only | ||
| COLGALT2 | COL9A2 | 0.984 | bioplex3_WMM bioplex3_HCT116 WMM_only | ||
| COL4A2 | COLGALT2 | 0.979 | 0.114 | bioplex3_HEK293 bioplex () bioplex_WMM bioplex3_WMM | |
| COLGALT2 | DOK1 | 0.959 | 0.11 | bioplex3_HEK293 bioplex () bioplex_WMM bioplex3_WMM | |
| COL9A2 | COL9A3 | 0.616 | bioplex3_WMM WMM_only | ||
| COL13A1 | COL9A2 | 0.616 | bioplex3_WMM WMM_only | ||
| COL13A1 | COL9A3 | 0.455 | bioplex3_WMM WMM_only | ||
| COL4A2 | COL13A1 | 0.326 | bioplex_WMM bioplex3_WMM WMM_only | ||
| COL4A2 | DOK1 | 0.22 | 0.076 | bioplex_WMM bioplex3_WMM WMM_only | |
| DOK1 | COL9A3 | 0.214 | bioplex3_WMM WMM_only | ||
| DOK1 | COL9A2 | 0.214 | bioplex3_WMM WMM_only | ||
| COL13A1 | DOK1 | 0.146 | bioplex3_WMM WMM_only | ||
| COL4A2 | COL9A3 | 0.072 | bioplex3_WMM WMM_only | ||
| COL4A2 | COL9A2 | 0.046 | bioplex3_WMM WMM_only |
Related Complexes