hu.MAP 3.0: Complex View
Human Protein Complex Map
Search for a protein
Complex: huMAP3_02103.1
Confidence: Extremely High
Proteins| Genename | Protein Name | Uniprot Annotation Score | Links |
|---|---|---|---|
| RPA3 | Replication protein A 14 kDa subunit (RP-A p14) (Replication factor A protein 3) (RF-A protein 3) | 5 | UniProt NCBI |
| HMCES | Abasic site processing protein HMCES (EC 4.-.-.-) (Embryonic stem cell-specific 5-hydroxymethylcytosine-binding protein) (ES cell-specific 5hmC-binding protein) (Peptidase HMCES) (EC 3.4.-.-) (SRAP domain-containing protein 1) | 5 | UniProt NCBI |
| RPA1 | Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit (RP-A p70) (Replication factor A protein 1) (RF-A protein 1) (Single-stranded DNA-binding protein) [Cleaved into: Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, N-terminally processed] | 5 | UniProt NCBI |
Enrichments
| Term ID | Corrected Pval | Fraction Complex Coverage | Proteins | Term Name |
|---|---|---|---|---|
| CORUM:5229 | 3.41752350426e-06 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | RPA complex |
| CORUM:2738 | 3.41705576683e-05 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | BLM complex II |
| CORUM:2222 | 3.41705576683e-05 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | BLM complex II |
| CORUM:1004 | 0.000122991556209 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | RC complex during S-phase of cell cycle |
| CORUM:248 | 0.000122991556209 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | BRAFT complex |
| CORUM:1005 | 0.0001537324292 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | RC complex during G2/M-phase of cell cycle |
| CORUM:244 | 0.000187886616059 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | BRAFT complex |
| KEGG:03430 | 0.000192947765955 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Mismatch repair |
| WP:WP531 | 0.000286309588192 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | DNA mismatch repair |
| REAC:R-HSA-3371511 | 0.000449812862905 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | HSF1 activation |
| KEGG:03030 | 0.000480177590636 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | DNA replication |
| KEGG:03440 | 0.000594396930969 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Homologous recombination |
| REAC:R-HSA-69166 | 0.000620139908703 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Removal of the Flap Intermediate |
| REAC:R-HSA-5358565 | 0.000620139908703 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Mismatch repair (MMR) directed by MSH2:MSH6 (MutSalpha) |
| REAC:R-HSA-5358606 | 0.000620139908703 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Mismatch repair (MMR) directed by MSH2:MSH3 (MutSbeta) |
| REAC:R-HSA-69183 | 0.000715513386354 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Processive synthesis on the lagging strand |
| REAC:R-HSA-5358508 | 0.000715513386354 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Mismatch Repair |
| REAC:R-HSA-5656121 | 0.000817692256233 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Translesion synthesis by POLI |
| REAC:R-HSA-110312 | 0.000817692256233 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Translesion synthesis by REV1 |
| KEGG:03460 | 0.000895799081076 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Fanconi anemia pathway |
| REAC:R-HSA-5655862 | 0.000926675585137 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Translesion synthesis by POLK |
| REAC:R-HSA-174437 | 0.000926675585137 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Removal of the Flap Intermediate from the C-strand |
| WP:WP466 | 0.000973512535349 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | DNA replication |
| WP:WP4753 | 0.00102095428698 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Nucleotide excision repair |
| REAC:R-HSA-174414 | 0.0011650518872 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Processive synthesis on the C-strand of the telomere |
| REAC:R-HSA-110320 | 0.0011650518872 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Translesion Synthesis by POLH |
| KEGG:03420 | 0.00125862804941 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Nucleotide excision repair |
| REAC:R-HSA-69186 | 0.00129444299395 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Lagging Strand Synthesis |
| REAC:R-HSA-5651801 | 0.00143063482691 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | PCNA-Dependent Long Patch Base Excision Repair |
| REAC:R-HSA-110373 | 0.00204339075673 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Resolution of AP sites via the multiple-nucleotide patch replacement pathway |
| REAC:R-HSA-5696397 | 0.00204339075673 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Gap-filling DNA repair synthesis and ligation in GG-NER |
| WP:WP45 | 0.00227715198732 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | G1 to S cell cycle control |
| REAC:R-HSA-110314 | 0.00296224002415 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Recognition of DNA damage by PCNA-containing replication complex |
| WP:WP5114 | 0.00296720799434 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Nucleotide excision repair in xeroderma pigmentosum |
| REAC:R-HSA-5656169 | 0.00316638779295 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Termination of translesion DNA synthesis |
| REAC:R-HSA-69190 | 0.0033773260227 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | DNA strand elongation |
| REAC:R-HSA-68962 | 0.00359505378021 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Activation of the pre-replicative complex |
| REAC:R-HSA-174417 | 0.00381957013228 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Telomere C-strand (Lagging Strand) Synthesis |
| REAC:R-HSA-9709570 | 0.00381957013228 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Impaired BRCA2 binding to RAD51 |
| REAC:R-HSA-6783310 | 0.00405087414568 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Fanconi Anemia Pathway |
| REAC:R-HSA-5685938 | 0.00405087414568 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | HDR through Single Strand Annealing (SSA) |
| REAC:R-HSA-73933 | 0.00405087414568 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Resolution of Abasic Sites (AP sites) |
| WP:WP2446 | 0.00412431213363 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Retinoblastoma gene in cancer |
| GO:0005657 | 0.00419852339422 | 1.0 | RPA3 HMCES RPA1 | replication fork |
| REAC:R-HSA-176187 | 0.00428896488724 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Activation of ATR in response to replication stress |
| REAC:R-HSA-110313 | 0.00478550282195 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Translesion synthesis by Y family DNA polymerases bypasses lesions on DNA template |
| REAC:R-HSA-5693616 | 0.00504394814871 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Presynaptic phase of homologous DNA pairing and strand exchange |
| REAC:R-HSA-9701190 | 0.00530917647079 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Defective homologous recombination repair (HRR) due to BRCA2 loss of function |
| REAC:R-HSA-9675136 | 0.00530917647079 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Diseases of DNA Double-Strand Break Repair |
| REAC:R-HSA-5696400 | 0.005581186855 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Dual Incision in GG-NER |
| REAC:R-HSA-5696395 | 0.00585997836812 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Formation of Incision Complex in GG-NER |
| REAC:R-HSA-5693579 | 0.00585997836812 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Homologous DNA Pairing and Strand Exchange |
| WP:WP4946 | 0.0071317033437 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | DNA repair pathways full network |
| REAC:R-HSA-73893 | 0.00735562020533 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | DNA Damage Bypass |
| REAC:R-HSA-9675135 | 0.00800131218049 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Diseases of DNA repair |
| REAC:R-HSA-180786 | 0.00867409880878 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Extension of Telomeres |
| HPA:0530723 | 0.00991771548705 | 1.0 | RPA3 HMCES RPA1 | spleen; cells in white pulp[High] |
| REAC:R-HSA-6782210 | 0.0132793882188 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Gap-filling DNA repair synthesis and ligation in TC-NER |
| REAC:R-HSA-6782135 | 0.0137071284674 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Dual incision in TC-NER |
| REAC:R-HSA-3371453 | 0.0141416283812 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Regulation of HSF1-mediated heat shock response |
| REAC:R-HSA-5685942 | 0.0145828870271 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | HDR through Homologous Recombination (HRR) |
| GO:0003697 | 0.0165038110528 | 1.0 | RPA3 HMCES RPA1 | single-stranded DNA binding |
| REAC:R-HSA-912446 | 0.017372320015 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Meiotic recombination |
| REAC:R-HSA-73884 | 0.0193669984414 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Base Excision Repair |
| HPA:0630223 | 0.0194009113254 | 1.0 | RPA3 HMCES RPA1 | cervix; squamous epithelial cells[High] |
| REAC:R-HSA-6781827 | 0.019882541548 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Transcription-Coupled Nucleotide Excision Repair (TC-NER) |
| REAC:R-HSA-5696399 | 0.0231174657298 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Global Genome Nucleotide Excision Repair (GG-NER) |
| REAC:R-HSA-3371556 | 0.0242497192193 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Cellular response to heat stress |
| HPA:0620223 | 0.0245360663978 | 1.0 | RPA3 HMCES RPA1 | vagina; squamous epithelial cells[High] |
| REAC:R-HSA-69473 | 0.0254089329805 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | G2/M DNA damage checkpoint |
| REAC:R-HSA-6804756 | 0.0265950995478 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Regulation of TP53 Activity through Phosphorylation |
| REAC:R-HSA-5693607 | 0.0271982878007 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Processing of DNA double-strand break ends |
| HPA:0600433 | 0.0311676675212 | 1.0 | RPA3 HMCES RPA1 | tonsil; germinal center cells[High] |
| REAC:R-HSA-1500620 | 0.0329299631783 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Meiosis |
| REAC:R-HSA-157579 | 0.0336004634561 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Telomere Maintenance |
| REAC:R-HSA-5696398 | 0.0392065258044 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Nucleotide Excision Repair |
| REAC:R-HSA-1474165 | 0.0421708333427 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Reproduction |
| REAC:R-HSA-69239 | 0.0476168581556 | 0.666666666667 | RPA3 RPA1 | Synthesis of DNA |
| CORUM:997 | 0.0499402709677 | 0.333333333333 | RPA1 | KIN17-PCNA-RPA70 complex |
| CORUM:5231 | 0.0499402709677 | 0.333333333333 | RPA1 | 53BP1-containing complex |
Edges
| Protein 1 | Protein 2 | Score | ProteomeHD | Evidence |
|---|---|---|---|---|
| RPA3 | RPA1 | 1.0 | 0.658 | hein_WMM bioplex_WMM Guru bioplex3_WMM boldt youn_WMM hein () Malo gupta_WMM fraction boldt_WMM |
| HMCES | RPA1 | 0.988 | 0.08 | bioplex3_HEK293 bioplex () bioplex_WMM bioplex3_WMM bioplex3_HCT116 |
| RPA3 | HMCES | 0.957 | 0.072 | bioplex3_HEK293 bioplex () bioplex_WMM bioplex3_WMM bioplex3_HCT116 |
Related Complexes