hu.MAP 3.0: Complex View
Human Protein Complex Map
Search for a protein
Complex: huMAP3_03121.1
Confidence: Extremely High
Proteins| Genename | Protein Name | Uniprot Annotation Score | Links |
|---|---|---|---|
| ERCC4 | DNA repair endonuclease XPF (EC 3.1.-.-) (DNA excision repair protein ERCC-4) (DNA repair protein complementing XP-F cells) (Xeroderma pigmentosum group F-complementing protein) | 5 | UniProt NCBI |
| SLX4 | Structure-specific endonuclease subunit SLX4 (BTB/POZ domain-containing protein 12) | 5 | UniProt NCBI |
| XPA | DNA repair protein complementing XP-A cells (Xeroderma pigmentosum group A-complementing protein) | 5 | UniProt NCBI |
Enrichments
| Term ID | Corrected Pval | Fraction Complex Coverage | Proteins | Term Name |
|---|---|---|---|---|
| WP:WP5114 | 4.82119522161e-06 | 1.0 | ERCC4 XPA SLX4 | Nucleotide excision repair in xeroderma pigmentosum |
| CORUM:531 | 1.02521027753e-05 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | XPA-ERCC1-ERCC4 complex |
| GO:0000109 | 1.58598067776e-05 | 1.0 | ERCC4 XPA SLX4 | nucleotide-excision repair complex |
| HP:0002860 | 2.96326829337e-05 | 1.0 | ERCC4 XPA SLX4 | Squamous cell carcinoma |
| HP:0001053 | 0.000171877354532 | 1.0 | ERCC4 XPA SLX4 | Hypopigmented skin patches |
| HP:0010649 | 0.000354217072454 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Flat nasal alae |
| HP:0010468 | 0.000547892893599 | 1.0 | ERCC4 XPA SLX4 | Aplasia/Hypoplasia of the testes |
| HP:0045058 | 0.000709041173276 | 1.0 | ERCC4 XPA SLX4 | Abnormality of the testis size |
| HP:0001034 | 0.000734362309502 | 1.0 | ERCC4 XPA SLX4 | Hypermelanotic macule |
| HP:0008069 | 0.000855780106254 | 1.0 | ERCC4 XPA SLX4 | Neoplasm of the skin |
| KEGG:03460 | 0.000895799081076 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Fanconi anemia pathway |
| HP:0001010 | 0.000899042784202 | 1.0 | ERCC4 XPA SLX4 | Hypopigmentation of the skin |
| WP:WP4753 | 0.00102095428698 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Nucleotide excision repair |
| HP:0007400 | 0.00113733389144 | 1.0 | ERCC4 XPA SLX4 | Irregular hyperpigmentation |
| HP:0009755 | 0.00115089028102 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Ankyloblepharon |
| HP:0012733 | 0.00118955132024 | 1.0 | ERCC4 XPA SLX4 | Macule |
| KEGG:03420 | 0.00125862804941 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Nucleotide excision repair |
| HP:0003079 | 0.00132788970801 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Defective DNA repair after ultraviolet radiation damage |
| GO:1901255 | 0.00140460216025 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | nucleotide-excision repair involved in interstrand cross-link repair |
| HP:0006739 | 0.00171977631115 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Squamous cell carcinoma of the skin |
| HP:0003254 | 0.00216216836724 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Abnormality of DNA repair |
| REAC:R-HSA-73894 | 0.00220643087689 | 1.0 | ERCC4 XPA SLX4 | DNA Repair |
| HP:0000524 | 0.0024022996104 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Conjunctival telangiectasia |
| HP:0000621 | 0.0024022996104 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Entropion |
| HP:0001029 | 0.00265505202111 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Poikiloderma |
| HP:0000953 | 0.00271630473377 | 1.0 | ERCC4 XPA SLX4 | Hyperpigmentation of the skin |
| HP:0004493 | 0.00292042386749 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Craniofacial hyperostosis |
| HP:0005522 | 0.00292042386749 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Pyridoxine-responsive sideroblastic anemia |
| HP:0010469 | 0.00319841341764 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Absent testis |
| HP:0008054 | 0.00348901893966 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Abnormal morphology of the conjunctival vasculature |
| REAC:R-HSA-6783310 | 0.00405087414568 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Fanconi Anemia Pathway |
| GO:0000110 | 0.00421361424067 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | nucleotide-excision repair factor 1 complex |
| GO:0070522 | 0.00421361424067 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | ERCC4-ERCC1 complex |
| HP:0010293 | 0.00443651401809 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Aplasia/Hypoplasia of the uvula |
| HP:0012848 | 0.00443651401809 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Small intestinal stenosis |
| HP:0100867 | 0.00443651401809 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Duodenal stenosis |
| HP:0100760 | 0.0047775661087 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Clubbing of toes |
| HP:0002245 | 0.0047775661087 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Meckel diverticulum |
| HP:0100587 | 0.00549749049527 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Abnormal preputium morphology |
| REAC:R-HSA-5696400 | 0.005581186855 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Dual Incision in GG-NER |
| REAC:R-HSA-5696395 | 0.00585997836812 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Formation of Incision Complex in GG-NER |
| HP:0001924 | 0.00626783027637 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Sideroblastic anemia |
| HP:0000135 | 0.00645685942958 | 1.0 | ERCC4 XPA SLX4 | Hypogonadism |
| WP:WP4946 | 0.0071317033437 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | DNA repair pathways full network |
| GO:0006289 | 0.00731242824493 | 1.0 | ERCC4 XPA SLX4 | nucleotide-excision repair |
| HP:0006887 | 0.0075178385046 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Intellectual disability, progressive |
| HP:0001059 | 0.00795970060154 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Pterygium |
| HP:0001549 | 0.00841415615575 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Abnormal ileum morphology |
| HP:0100579 | 0.00841415615575 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Mucosal telangiectasiae |
| HP:0040012 | 0.00841415615575 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Chromosome breakage |
| HP:0004437 | 0.00936084070842 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Cranial hyperostosis |
| HP:0001480 | 0.0103578783075 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Freckling |
| HP:0001000 | 0.0107692028076 | 1.0 | ERCC4 XPA SLX4 | Abnormality of skin pigmentation |
| HP:0100012 | 0.0114052550978 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Neoplasm of the eye |
| HP:0100774 | 0.0119478163599 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Hyperostosis |
| HP:0012740 | 0.0119478163599 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Papilloma |
| HP:0000813 | 0.0125029572242 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Bicornuate uterus |
| HP:0000498 | 0.0130706759587 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Blepharitis |
| REAC:R-HSA-6782135 | 0.0137071284674 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Dual incision in TC-NER |
| HP:0007874 | 0.0142438401108 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Almond-shaped palpebral fissure |
| HP:0100026 | 0.0148492820647 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Arteriovenous malformation |
| HP:0003022 | 0.0160978770685 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Hypoplasia of the ulna |
| HP:0003220 | 0.0167410266547 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Abnormality of chromosome stability |
| HP:0200005 | 0.0173967419879 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Abnormal shape of the palpebral fissure |
| HP:0009777 | 0.0173967419879 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Absent thumb |
| HP:0006495 | 0.0187458629677 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Aplasia/Hypoplasia of the ulna |
| REAC:R-HSA-6781827 | 0.019882541548 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Transcription-Coupled Nucleotide Excision Repair (TC-NER) |
| HP:0007565 | 0.0201452261528 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Multiple cafe-au-lait spots |
| HP:0000995 | 0.0208637442425 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Melanocytic nevus |
| HP:0000656 | 0.0215948176879 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Ectropion |
| HP:0011017 | 0.0218534403487 | 1.0 | ERCC4 XPA SLX4 | Abnormal cellular physiology |
| HP:0008373 | 0.0219766740349 | 1.0 | ERCC4 XPA SLX4 | Puberty and gonadal disorders |
| REAC:R-HSA-5696399 | 0.0231174657298 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Global Genome Nucleotide Excision Repair (GG-NER) |
| HP:0025354 | 0.0250749987795 | 1.0 | ERCC4 XPA SLX4 | Abnormal cellular phenotype |
| HP:0001199 | 0.0254384546332 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Triphalangeal thumb |
| HP:0000072 | 0.0270637362845 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Hydroureter |
| HP:0002861 | 0.0287391839378 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Melanoma |
| HP:0009821 | 0.0304647837379 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Forearm undergrowth |
| HP:0100585 | 0.0304647837379 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Telangiectasia of the skin |
| HP:0006501 | 0.0313463863633 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Aplasia/Hypoplasia of the radius |
| HP:0007759 | 0.0331471884053 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Opacification of the corneal stroma |
| HP:0000481 | 0.0338995606663 | 1.0 | ERCC4 XPA SLX4 | Abnormal cornea morphology |
| HP:0000491 | 0.0340663843581 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Keratitis |
| HP:0008572 | 0.0349981079563 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | External ear malformation |
| HP:0009380 | 0.0359423574679 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Aplasia of the fingers |
| HP:0200034 | 0.0388502441646 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Papule |
| HP:0009824 | 0.0388502441646 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Upper limb undergrowth |
| HP:0002246 | 0.0388502441646 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Abnormal duodenum morphology |
| REAC:R-HSA-5696398 | 0.0392065258044 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Nucleotide Excision Repair |
| HP:0000028 | 0.0407427395301 | 1.0 | ERCC4 XPA SLX4 | Cryptorchidism |
| HP:0005344 | 0.0408514331117 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Abnormal carotid artery morphology |
| HP:0000963 | 0.0408514331117 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Thin skin |
| HP:0011492 | 0.0408514331117 | 0.666666666667 | ERCC4 XPA | Abnormal corneal stroma morphology |
| HP:0000080 | 0.0424427653377 | 1.0 | ERCC4 XPA SLX4 | Abnormality of reproductive system physiology |
| HP:0002575 | 0.045003983416 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Tracheoesophageal fistula |
| HP:0000027 | 0.047155317063 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Azoospermia |
| HP:0006503 | 0.0482497424485 | 0.666666666667 | ERCC4 SLX4 | Aplasia/hypoplasia involving forearm bones |
| HP:0000518 | 0.0490800611352 | 1.0 | ERCC4 XPA SLX4 | Cataract |
| CORUM:2220 | 0.0499402709677 | 0.333333333333 | ERCC4 | RAD52-ERCC4-ERCC1 complex |
Edges
| Protein 1 | Protein 2 | Score | ProteomeHD | Evidence |
|---|---|---|---|---|
| ERCC4 | XPA | 0.994 | 0.158 | bioplex3_HEK293 bioplex () bioplex_WMM bioplex3_WMM |
| ERCC4 | SLX4 | 0.968 | 0.166 | hein_WMM bioplex3_HEK293 bioplex_WMM bioplex3_WMM WMM_only |
Related Complexes