hu.MAP 3.0: Complex View
Human Protein Complex Map
Search for a protein
Complex: huMAP3_03515.1
Confidence: Extremely High
Proteins| Genename | Protein Name | Uniprot Annotation Score | Links |
|---|---|---|---|
| POLD2 | DNA polymerase delta subunit 2 (DNA polymerase delta subunit p50) | 5 | UniProt NCBI |
| POLD4 | DNA polymerase delta subunit 4 (DNA polymerase delta subunit p12) | 5 | UniProt NCBI |
| REV3L | DNA polymerase zeta catalytic subunit (EC 2.7.7.7) (Protein reversionless 3-like) (REV3-like) (hREV3) | 5 | UniProt NCBI |
Enrichments
| Term ID | Corrected Pval | Fraction Complex Coverage | Proteins | Term Name |
|---|---|---|---|---|
| REAC:R-HSA-110313 | 3.93625566272e-06 | 1.0 | REV3L POLD2 POLD4 | Translesion synthesis by Y family DNA polymerases bypasses lesions on DNA template |
| REAC:R-HSA-73893 | 7.56595371871e-06 | 1.0 | REV3L POLD2 POLD4 | DNA Damage Bypass |
| WP:WP4946 | 1.81493241431e-05 | 1.0 | REV3L POLD2 POLD4 | DNA repair pathways full network |
| CORUM:297 | 2.05032700758e-05 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | PCNA-DNA polymerase delta complex |
| WP:WP186 | 7.47269756116e-05 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Homologous recombination |
| GO:0042575 | 0.000109576846827 | 1.0 | REV3L POLD2 POLD4 | DNA polymerase complex |
| CORUM:1107 | 0.000122991556209 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | DNA synthesome core complex |
| CORUM:1098 | 0.0001537324292 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | DNA synthesome complex (13 subunits) |
| KEGG:03430 | 0.000192947765955 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Mismatch repair |
| CORUM:1108 | 0.000266433060428 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | DNA synthesome complex (15 subunits) |
| WP:WP531 | 0.000286309588192 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | DNA mismatch repair |
| CORUM:1111 | 0.000310824382464 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | DNA synthesome complex (17 subunits) |
| CORUM:1099 | 0.000310824382464 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | DNA synthesome complex (17 subunits) |
| KEGG:03030 | 0.000480177590636 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | DNA replication |
| WP:WP4752 | 0.000492114068528 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Base excision repair |
| KEGG:03440 | 0.000594396930969 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Homologous recombination |
| REAC:R-HSA-69091 | 0.000620139908703 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Polymerase switching |
| REAC:R-HSA-69166 | 0.000620139908703 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Removal of the Flap Intermediate |
| REAC:R-HSA-5358565 | 0.000620139908703 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Mismatch repair (MMR) directed by MSH2:MSH6 (MutSalpha) |
| REAC:R-HSA-69109 | 0.000620139908703 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Leading Strand Synthesis |
| REAC:R-HSA-5358606 | 0.000620139908703 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Mismatch repair (MMR) directed by MSH2:MSH3 (MutSbeta) |
| GO:0000731 | 0.000629105668845 | 1.0 | REV3L POLD2 POLD4 | DNA synthesis involved in DNA repair |
| KEGG:03410 | 0.000688034410789 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Base excision repair |
| REAC:R-HSA-69183 | 0.000715513386354 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Processive synthesis on the lagging strand |
| REAC:R-HSA-5358508 | 0.000715513386354 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Mismatch Repair |
| REAC:R-HSA-174437 | 0.000926675585137 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Removal of the Flap Intermediate from the C-strand |
| WP:WP466 | 0.000973512535349 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | DNA replication |
| WP:WP4753 | 0.00102095428698 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Nucleotide excision repair |
| REAC:R-HSA-174414 | 0.0011650518872 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Processive synthesis on the C-strand of the telomere |
| KEGG:03420 | 0.00125862804941 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Nucleotide excision repair |
| REAC:R-HSA-69186 | 0.00129444299395 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Lagging Strand Synthesis |
| REAC:R-HSA-5651801 | 0.00143063482691 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | PCNA-Dependent Long Patch Base Excision Repair |
| REAC:R-HSA-110373 | 0.00204339075673 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Resolution of AP sites via the multiple-nucleotide patch replacement pathway |
| REAC:R-HSA-5696397 | 0.00204339075673 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Gap-filling DNA repair synthesis and ligation in GG-NER |
| REAC:R-HSA-73894 | 0.00220643087689 | 1.0 | REV3L POLD2 POLD4 | DNA Repair |
| REAC:R-HSA-174411 | 0.00221357222266 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Polymerase switching on the C-strand of the telomere |
| REAC:R-HSA-110314 | 0.00296224002415 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Recognition of DNA damage by PCNA-containing replication complex |
| WP:WP5114 | 0.00296720799434 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Nucleotide excision repair in xeroderma pigmentosum |
| REAC:R-HSA-5656169 | 0.00316638779295 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Termination of translesion DNA synthesis |
| REAC:R-HSA-69190 | 0.0033773260227 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | DNA strand elongation |
| REAC:R-HSA-174417 | 0.00381957013228 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Telomere C-strand (Lagging Strand) Synthesis |
| REAC:R-HSA-73933 | 0.00405087414568 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Resolution of Abasic Sites (AP sites) |
| REAC:R-HSA-5696400 | 0.005581186855 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Dual Incision in GG-NER |
| GO:0043625 | 0.00842684400117 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | delta DNA polymerase complex |
| GO:0016035 | 0.00842684400117 | 0.666666666667 | POLD2 REV3L | zeta DNA polymerase complex |
| REAC:R-HSA-180786 | 0.00867409880878 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Extension of Telomeres |
| REAC:R-HSA-6782210 | 0.0132793882188 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Gap-filling DNA repair synthesis and ligation in TC-NER |
| REAC:R-HSA-6782135 | 0.0137071284674 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Dual incision in TC-NER |
| REAC:R-HSA-5685942 | 0.0145828870271 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | HDR through Homologous Recombination (HRR) |
| REAC:R-HSA-73884 | 0.0193669984414 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Base Excision Repair |
| REAC:R-HSA-6781827 | 0.019882541548 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Transcription-Coupled Nucleotide Excision Repair (TC-NER) |
| REAC:R-HSA-5696399 | 0.0231174657298 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Global Genome Nucleotide Excision Repair (GG-NER) |
| REAC:R-HSA-157579 | 0.0336004634561 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Telomere Maintenance |
| REAC:R-HSA-5696398 | 0.0392065258044 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Nucleotide Excision Repair |
| GO:0006261 | 0.0439566559847 | 1.0 | REV3L POLD2 POLD4 | DNA-templated DNA replication |
| GO:0071897 | 0.0458676185213 | 1.0 | REV3L POLD2 POLD4 | DNA biosynthetic process |
| REAC:R-HSA-69239 | 0.0476168581556 | 0.666666666667 | POLD2 POLD4 | Synthesis of DNA |
Edges
| Protein 1 | Protein 2 | Score | ProteomeHD | Evidence |
|---|---|---|---|---|
| POLD2 | REV3L | 0.997 | bioplex3_HEK293 bioplex () bioplex_WMM bioplex3_WMM bioplex3_HCT116 | |
| POLD2 | POLD4 | 0.996 | 0.122 | hein_WMM bioplex3_HEK293 bioplex () bioplex_WMM bioplex3_WMM bioplex3_HCT116 |
| POLD4 | REV3L | 0.912 | bioplex_WMM bioplex3_WMM WMM_only |
Related Complexes
| Genename | Complexes |
|---|---|
| POLD2 | huMAP3_03515.1 huMAP3_04554.1 huMAP3_08117.1 huMAP3_13172.1 |
| POLD4 | huMAP3_03515.1 huMAP3_04554.1 huMAP3_08117.1 huMAP3_13172.1 |
| REV3L | huMAP3_03515.1 huMAP3_04554.1 huMAP3_08117.1 huMAP3_13172.1 |