hu.MAP 3.0: Complex View
Human Protein Complex Map
Search for a protein
Complex: huMAP3_05537.1
Confidence: Very High
Proteins| Genename | Protein Name | Uniprot Annotation Score | Links |
|---|---|---|---|
| RAD50 | DNA repair protein RAD50 (hRAD50) (EC 3.6.-.-) | 5 | UniProt NCBI |
| ASTN2 | Astrotactin-2 | 5 | UniProt NCBI |
| NBN | Nibrin (Cell cycle regulatory protein p95) (Nijmegen breakage syndrome protein 1) | 5 | UniProt NCBI |
Enrichments
| Term ID | Corrected Pval | Fraction Complex Coverage | Proteins | Term Name |
|---|---|---|---|---|
| CORUM:331 | 1.02521027753e-05 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | MRN complex (MRE11-RAD50-NBN complex) |
| CORUM:73 | 1.02521027753e-05 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | MRN complex (MRE11-RAD50-NBN complex) |
| CORUM:173 | 1.02521027753e-05 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | MRN complex (MRE11-RAD50-NBN complex) |
| CORUM:618 | 1.02521027753e-05 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | MRN complex (MRE11-RAD50-NBN complex) |
| CORUM:972 | 1.02521027753e-05 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | MRN complex (MRE11-RAD50-NBN complex) |
| CORUM:1081 | 1.02521027753e-05 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | MRN complex (MRE11-RAD50-NBN complex) |
| CORUM:71 | 1.02521027753e-05 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | MRN complex (MRE11-RAD50-NBN complex) |
| CORUM:2767 | 1.02521027753e-05 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | RAD50-MRE11-NBN-p200-p350 complex |
| CORUM:202 | 2.05032700758e-05 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | BRCA1-RAD50-MRE11-NBS1 complex |
| CORUM:619 | 2.05032700758e-05 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | MRE11A-RAD50-NBN-TRF2 complex |
| CORUM:627 | 2.05032700758e-05 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | MRN-TRRAP complex (MRE11A-RAD50-NBN-TRRAP complex) |
| CORUM:964 | 2.05032700758e-05 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | BRCA1-RAD50-MRE11-NBS1 complex |
| CORUM:2218 | 2.05032700758e-05 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | MDC1-MRE11-RAD50-NBS1 complex |
| WP:WP2942 | 2.37821910987e-05 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | DDX1 as a regulatory component of the Drosha microprocessor |
| CORUM:1189 | 3.41705576683e-05 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | DNA double-strand break end-joining complex |
| CORUM:2217 | 5.12534978153e-05 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | MDC1-MRN-ATM-FANCD2 complex |
| CORUM:5197 | 5.12534978153e-05 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | PTIP-DNA damage response complex |
| WP:WP5118 | 6.22753219356e-05 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | SMC1 SMC3 role in DNA damage Cornelia de Lange Syndrome |
| WP:WP186 | 7.47269756116e-05 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Homologous recombination |
| CORUM:2815 | 9.56644648234e-05 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | BRCA1-BARD1-BACH1-DNA damage complex II |
| REAC:R-HSA-5693548 | 0.000102258192243 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Sensing of DNA Double Strand Breaks |
| CORUM:433 | 0.000225453649047 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | BASC complex (BRCA1-associated genome surveillance complex) |
| REAC:R-HSA-5685939 | 0.000374861161166 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | HDR through MMEJ (alt-NHEJ) |
| KEGG:03440 | 0.000594396930969 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Homologous recombination |
| WP:WP2516 | 0.00079501095268 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | ATM signaling pathway |
| WP:WP3878 | 0.000927197171072 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | ATM signaling in development and disease |
| HP:0030406 | 0.00115089028102 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Primary peritoneal carcinoma |
| WP:WP3959 | 0.00149859190216 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | DNA IR double strand breaks and cellular response via ATM |
| REAC:R-HSA-9709603 | 0.00188000535098 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Impaired BRCA2 binding to PALB2 |
| REAC:R-HSA-9701193 | 0.00204339075673 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Defective homologous recombination repair (HRR) due to PALB2 loss of function |
| REAC:R-HSA-9704646 | 0.00204339075673 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Defective HDR through Homologous Recombination Repair (HRR) due to PALB2 loss of BRCA2/RAD51/RAD51C binding function |
| REAC:R-HSA-9701192 | 0.00204339075673 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Defective homologous recombination repair (HRR) due to BRCA1 loss of function |
| REAC:R-HSA-9704331 | 0.00204339075673 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Defective HDR through Homologous Recombination Repair (HRR) due to PALB2 loss of BRCA1 binding function |
| WP:WP1530 | 0.00234933503753 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | miRNA regulation of DNA damage response |
| WP:WP707 | 0.00234933503753 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | DNA damage response |
| REAC:R-HSA-5693554 | 0.00239054881557 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Resolution of D-loop Structures through Synthesis-Dependent Strand Annealing (SDSA) |
| WP:WP4016 | 0.0033030673862 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | DNA IR damage and cellular response via ATR |
| REAC:R-HSA-5693568 | 0.00359505378021 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Resolution of D-loop Structures through Holliday Junction Intermediates |
| REAC:R-HSA-5693537 | 0.00381957013228 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Resolution of D-Loop Structures |
| REAC:R-HSA-9709570 | 0.00381957013228 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Impaired BRCA2 binding to RAD51 |
| REAC:R-HSA-5685938 | 0.00405087414568 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | HDR through Single Strand Annealing (SSA) |
| HP:0011027 | 0.00410807097178 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Abnormal fallopian tube morphology |
| REAC:R-HSA-5693616 | 0.00504394814871 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Presynaptic phase of homologous DNA pairing and strand exchange |
| REAC:R-HSA-9675136 | 0.00530917647079 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Diseases of DNA Double-Strand Break Repair |
| REAC:R-HSA-9701190 | 0.00530917647079 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Defective homologous recombination repair (HRR) due to BRCA2 loss of function |
| REAC:R-HSA-5693579 | 0.00585997836812 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Homologous DNA Pairing and Strand Exchange |
| HP:0012125 | 0.00667190161012 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Prostate cancer |
| HP:0100787 | 0.00667190161012 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Prostate neoplasm |
| WP:WP4946 | 0.0071317033437 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | DNA repair pathways full network |
| KEGG:04218 | 0.00738083489308 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Cellular senescence |
| REAC:R-HSA-9675135 | 0.00800131218049 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Diseases of DNA repair |
| GO:0031860 | 0.00842684400117 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | telomeric 3' overhang formation |
| HP:0008775 | 0.00936084070842 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Abnormal prostate morphology |
| WP:WP4262 | 0.00988379918205 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Breast cancer pathway |
| REAC:R-HSA-5693571 | 0.01244419045 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Nonhomologous End-Joining (NHEJ) |
| GO:0030870 | 0.0140440992017 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Mre11 complex |
| HP:0033019 | 0.0142438401108 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Male reproductive system neoplasm |
| REAC:R-HSA-5685942 | 0.0145828870271 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | HDR through Homologous Recombination (HRR) |
| REAC:R-HSA-2559586 | 0.0150309034717 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | DNA Damage/Telomere Stress Induced Senescence |
| HP:0003220 | 0.0167410266547 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Abnormality of chromosome stability |
| REAC:R-HSA-5693565 | 0.0168905285744 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Recruitment and ATM-mediated phosphorylation of repair and signaling proteins at DNA double strand breaks |
| REAC:R-HSA-5693606 | 0.017372320015 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | DNA Double Strand Break Response |
| REAC:R-HSA-912446 | 0.017372320015 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Meiotic recombination |
| GO:0070533 | 0.0210651876021 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | BRCA1-C complex |
| HP:0000022 | 0.024644630388 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Abnormal male internal genitalia morphology |
| REAC:R-HSA-69473 | 0.0254089329805 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | G2/M DNA damage checkpoint |
| HP:0100615 | 0.0262448238426 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Ovarian neoplasm |
| REAC:R-HSA-6804756 | 0.0265950995478 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Regulation of TP53 Activity through Phosphorylation |
| REAC:R-HSA-5693607 | 0.0271982878007 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Processing of DNA double-strand break ends |
| HP:0003002 | 0.0278951902268 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Breast carcinoma |
| HP:0002861 | 0.0287391839378 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Melanoma |
| GO:1904354 | 0.0294899169624 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | negative regulation of telomere capping |
| REAC:R-HSA-1500620 | 0.0329299631783 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Meiosis |
| HP:0002894 | 0.0388502441646 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Neoplasm of the pancreas |
| GO:0110025 | 0.0393180950424 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | DNA strand resection involved in replication fork processing |
| REAC:R-HSA-1474165 | 0.0421708333427 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Reproduction |
| HP:0010785 | 0.0460733968082 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Gonadal neoplasm |
| HP:0100013 | 0.0482497424485 | 0.666666666667 | RAD50 NBN | Neoplasm of the breast |
| CORUM:72 | 0.0499402709677 | 0.333333333333 | RAD50 | R/M complex (RAD50-MRE11 complex) |
| CORUM:2723 | 0.0499402709677 | 0.333333333333 | NBN | ATM-NBN complex |
| CORUM:264 | 0.0499402709677 | 0.333333333333 | RAD50 | R/M complex (RAD50-MRE11 complex) |
| CORUM:2776 | 0.0499402709677 | 0.333333333333 | RAD50 | RAD50-BRCA1 complex |
| CORUM:7103 | 0.0499402709677 | 0.333333333333 | NBN | NBS1-VRK1 complex |
| CORUM:263 | 0.0499402709677 | 0.333333333333 | RAD50 | R/M complex (RAD50-MRE11 complex) |
| CORUM:7104 | 0.0499402709677 | 0.333333333333 | NBN | NBS1-RNF8-VRK1 complex |
Edges
| Protein 1 | Protein 2 | Score | ProteomeHD | Evidence |
|---|---|---|---|---|
| RAD50 | ASTN2 | 0.955 | 0.094 | bioplex3_WMM bioplex3_HCT116 WMM_only |
| RAD50 | NBN | 0.951 | 0.522 | bioplex_WMM bioplex3_WMM youn_WMM Malo gupta_WMM fraction |
Related Complexes