hu.MAP 3.0: Complex View

Human Protein Complex Map

Complex: huMAP3_07562.1

Confidence: Very High

Genename	Protein Name	Uniprot Annotation Score	Links
RNF144A	E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A (EC 2.3.2.31) (RING finger protein 144A) (UbcM4-interacting protein 4) (Ubiquitin-conjugating enzyme 7-interacting protein 4)	5	UniProt NCBI
COL1A1	Collagen alpha-1(I) chain (Alpha-1 type I collagen)	5	UniProt NCBI
COL1A2	Collagen alpha-2(I) chain (Alpha-2 type I collagen)	5	UniProt NCBI

Enrichments

Term ID	Corrected Pval	Fraction Complex Coverage	Proteins	Term Name
HP:0005897	1.26540735158e-05	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Severe generalized osteoporosis
HP:0005623	1.26540735158e-05	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Absent ossification of calvaria
HP:0005005	1.26540735158e-05	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Femoral bowing present at birth, straightening with time
HP:0003321	1.26540735158e-05	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Biconcave flattened vertebrae
HP:0003023	7.59175135241e-05	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Bowing of limbs due to multiple fractures
HP:0000362	0.000126523416231	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Otosclerosis
HP:0005758	0.000126523416231	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Basilar impression
HP:0006367	0.000189776464884	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Crumpled long bones
REAC:R-HSA-430116	0.00024538606603	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	GP1b-IX-V activation signalling
HP:0000923	0.000265674927589	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Beaded ribs
WP:WP453	0.000286309588192	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Inflammatory response pathway
REAC:R-HSA-75892	0.000306718584473	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Platelet Adhesion to exposed collagen
WP:WP5036	0.000312323469599	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Angiotensin II receptor type 1 pathway
HP:0025019	0.000354217072454	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Arterial rupture
HP:0008921	0.000455401167586	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Neonatal short-limb short stature
WP:WP4786	0.000526028939796	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Type I collagen synthesis in the context of osteogenesis imperfecta
REAC:R-HSA-2214320	0.000531572756485	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Anchoring fibril formation
HP:0031869	0.000695688281083	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Recurrent joint dislocation
HP:0008628	0.000695688281083	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Abnormality of the stapes
REAC:R-HSA-2243919	0.000817692256233	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Crosslinking of collagen fibrils
HP:0003179	0.000834787835662	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Protrusio acetabuli
HP:0001027	0.000834787835662	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Soft, doughy skin
REAC:R-HSA-3000480	0.000926675585137	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Scavenging by Class A Receptors
HP:0010547	0.000986522412937	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Muscle flaccidity
WP:WP5144	0.00122198206637	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	NRP1 triggered signaling pathways in pancreatic cancer
HP:0003834	0.00132788970801	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Shoulder dislocation
GO:0005584	0.00140460216025	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	collagen type I trimer
REAC:R-HSA-3000170	0.00157362645287	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Syndecan interactions
KEGG:04512	0.00168280767129	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	ECM-receptor interaction
HP:0005855	0.00171977631115	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Multiple prenatal fractures
HP:0002691	0.00171977631115	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Platybasia
HP:0100541	0.00171977631115	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Femoral hernia
HP:0040160	0.00171977631115	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Generalized osteoporosis
HP:0005474	0.00171977631115	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Decreased calvarial ossification
KEGG:04974	0.00178539371798	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Protein digestion and absorption
WP:WP5055	0.00180332266367	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Burn wound healing
REAC:R-HSA-8874081	0.00188000535098	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	MET activates PTK2 signaling
HP:0004452	0.00193466002352	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Abnormality of the middle ear ossicles
HP:0000703	0.00193466002352	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Dentinogenesis imperfecta
REAC:R-HSA-114604	0.00239054881557	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	GPVI-mediated activation cascade
HP:0010299	0.0024022996104	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Abnormal dentin morphology
REAC:R-HSA-76009	0.00257431960226	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Platelet Aggregation (Plug Formation)
KEGG:05146	0.00277942774223	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Amoebiasis
KEGG:04933	0.0028446957576	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications
REAC:R-HSA-8948216	0.00296224002415	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Collagen chain trimerization
HP:0010444	0.00319841341764	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Pulmonary insufficiency
HP:0010648	0.00319841341764	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Dermal translucency
HP:0004586	0.00348901893966	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Biconcave vertebral bodies
KEGG:04611	0.00361241039138	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Platelet activation
REAC:R-HSA-8875878	0.00381957013228	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	MET promotes cell motility
REAC:R-HSA-2173782	0.00405087414568	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Binding and Uptake of Ligands by Scavenger Receptors
HP:0008609	0.00410807097178	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Abnormal middle ear morphology
HP:0001591	0.00410807097178	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Bell-shaped thorax
KEGG:04926	0.00438942625854	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Relaxin signaling pathway
HP:0032153	0.00443651401809	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Joint subluxation
HP:0005743	0.0047775661087	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Avascular necrosis of the capital femoral epiphysis
HP:0002982	0.0047775661087	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Tibial bowing
HP:0001030	0.00587635932745	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Fragile skin
HP:0001075	0.00667190161012	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Atrophic scars
HP:0000015	0.00667190161012	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Bladder diverticulum
HP:0000977	0.00708857159683	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Soft skin
REAC:R-HSA-2022090	0.00735562020533	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Assembly of collagen fibrils and other multimeric structures
REAC:R-HSA-3000171	0.00767507889467	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Non-integrin membrane-ECM interactions
REAC:R-HSA-1442490	0.00800131218049	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Collagen degradation
HP:0004331	0.00841415615575	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Decreased skull ossification
HP:0001058	0.00841415615575	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Poor wound healing
HP:0006094	0.00841415615575	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Finger joint hypermobility
HP:0100323	0.00888120343534	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Juvenile aseptic necrosis
HP:0002980	0.00888120343534	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Femoral bowing
REAC:R-HSA-1650814	0.00902065028483	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Collagen biosynthesis and modifying enzymes
HP:0010529	0.00936084070842	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Echolalia
HP:0006256	0.0103578783075	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Abnormality of hand joint mobility
HP:4000074	0.0103578783075	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Idiosyncratic language
HP:4000072	0.0103578783075	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Abnormal language feature
REAC:R-HSA-3000178	0.0112421146161	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	ECM proteoglycans
KEGG:04510	0.0112688274497	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Focal adhesion
HP:0003100	0.0119478163599	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Slender long bone
HP:0002703	0.0119478163599	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Abnormality of skull ossification
KEGG:05205	0.0124702277162	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Proteoglycans in cancer
KEGG:05415	0.0124702277162	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Diabetic cardiomyopathy
HP:0000883	0.0125029572242	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Thin ribs
HP:0001623	0.0130706759587	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Breech presentation
REAC:R-HSA-216083	0.0132793882188	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Integrin cell surface interactions
HP:0430046	0.0142438401108	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Small joint hypermobilty
HP:0002300	0.0154672949612	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Mutism
REAC:R-HSA-6806834	0.0159472060247	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Signaling by MET
WP:WP306	0.0167214858931	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Focal adhesion
HP:0002645	0.0167410266547	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Wormian bones
HP:0002812	0.0167410266547	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Coxa vara
REAC:R-HSA-1474290	0.017372320015	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Collagen formation
HP:0001001	0.0187458629677	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Abnormality of subcutaneous fat tissue
HP:0002616	0.0208637442425	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Aortic root aneurysm
HP:0001790	0.0215948176879	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Nonimmune hydrops fetalis
HP:0000974	0.022338444757	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Hyperextensible skin
HP:0001822	0.023863352839	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Hallux valgus
HP:0000987	0.0278951902268	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Atypical scarring of skin
HP:0025487	0.0287391839378	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Abnormal bladder morphology
HP:0010574	0.0287391839378	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Abnormality of the epiphysis of the femoral head
GO:0098643	0.0294899169624	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	banded collagen fibril
GO:0043589	0.0294899169624	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	skin morphogenesis
GO:0005583	0.0294899169624	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	fibrillar collagen trimer
HP:0010051	0.0295957156854	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Deviation of the hallux
HP:0006499	0.0304647837379	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Abnormal femoral epiphysis morphology
KEGG:04151	0.0307080825491	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	PI3K-Akt signaling pathway
REAC:R-HSA-198933	0.0316091445651	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Immunoregulatory interactions between a Lymphoid and a non-Lymphoid cell
KEGG:05165	0.0324411425615	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Human papillomavirus infection
HP:0003043	0.0340663843581	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Abnormal shoulder morphology
WP:WP3932	0.0343043102958	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Focal adhesion PI3K Akt mTOR signaling pathway
REAC:R-HSA-202733	0.0349616412881	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Cell surface interactions at the vascular wall
HP:0006500	0.0349981079563	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Abnormal lower limb epiphysis morphology
HP:0003170	0.0359423574679	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Abnormal acetabulum morphology
HP:0002992	0.0368991311611	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Abnormal tibia morphology
HP:0003368	0.0368991311611	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Abnormal femoral head morphology
HP:0034670	0.0368991311611	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Abnormal knee physiology
REAC:R-HSA-1474228	0.037053837229	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Degradation of the extracellular matrix
HP:0030310	0.037868427304	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Upper extremity joint dislocation
HP:0000260	0.0388502441646	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Wide anterior fontanel
HP:0000444	0.0388502441646	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Convex nasal ridge
HP:0001787	0.0398445800112	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Abnormal delivery
HP:0010885	0.0398445800112	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Avascular necrosis
HP:0000963	0.0408514331117	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Thin skin
WP:WP4172	0.0409328508823	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	PI3K Akt signaling pathway
HP:0002673	0.0439470786184	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Coxa valga
HP:0002381	0.0439470786184	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Aphasia
HP:0100699	0.0493566712329	0.666666666667	COL1A1 COL1A2	Scarring
CORUM:3059	0.0499402709677	0.333333333333	COL1A1	ITGA11-ITGB1-COL1A1 complex

Edges

Protein 1	Protein 2	Score	ProteomeHD	Evidence
COL1A1	COL1A2	0.998	0.616	bioplex_WMM bioplex3_WMM boldt boldt_WMM treiber_WMM WMM_only
RNF144A	COL1A2	0.996		bioplex3_WMM bioplex3_HCT116 WMM_only
RNF144A	COL1A1	0.967		bioplex3_WMM bioplex3_HCT116 WMM_only

Related Complexes

Genename	Complexes
RNF144A	huMAP3_00343.1 huMAP3_05513.1 huMAP3_07562.1 huMAP3_09606.1 huMAP3_11227.1
COL1A1	huMAP3_02069.1 huMAP3_02141.1 huMAP3_06460.1 huMAP3_07562.1 huMAP3_09231.1 huMAP3_09523.1 huMAP3_09606.1 huMAP3_10652.1 huMAP3_10780.1 huMAP3_14070.1
COL1A2	huMAP3_02069.1 huMAP3_02141.1 huMAP3_06460.1 huMAP3_07562.1 huMAP3_09231.1 huMAP3_09523.1 huMAP3_09606.1 huMAP3_10652.1 huMAP3_10780.1 huMAP3_14070.1

hu.MAP 3.0: Complex View

Search for a protein

Complex: huMAP3_07562.1