hu.MAP 3.0: Complex View
Human Protein Complex Map
Search for a protein
Complex: huMAP3_08497.1
Confidence: High
Proteins| Genename | Protein Name | Uniprot Annotation Score | Links |
|---|---|---|---|
| RFC5 | Replication factor C subunit 5 (Activator 1 36 kDa subunit) (A1 36 kDa subunit) (Activator 1 subunit 5) (Replication factor C 36 kDa subunit) (RF-C 36 kDa subunit) (RFC36) | 5 | UniProt NCBI |
| RFC4 | Replication factor C subunit 4 (Activator 1 37 kDa subunit) (A1 37 kDa subunit) (Activator 1 subunit 4) (Replication factor C 37 kDa subunit) (RF-C 37 kDa subunit) (RFC37) | 5 | UniProt NCBI |
| ATAD5 | ATPase family AAA domain-containing protein 5 (Chromosome fragility-associated gene 1 protein) | 5 | UniProt NCBI |
Enrichments
| Term ID | Corrected Pval | Fraction Complex Coverage | Proteins | Term Name |
|---|---|---|---|---|
| CORUM:278 | 1.02521027753e-05 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | RFC core complex |
| WP:WP5366 | 1.10755092492e-05 | 1.0 | ATAD5 RFC5 RFC4 | NF1 copy number variation syndrome |
| CORUM:2201 | 2.05032700758e-05 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | PCNA-RFC2-5 complex |
| CORUM:2200 | 2.05032700758e-05 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | RFC2-5 subcomplex |
| CORUM:270 | 3.41705576683e-05 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | RAD17-RFC complex |
| CORUM:277 | 3.41705576683e-05 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | RFC complex |
| CORUM:279 | 3.41705576683e-05 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | RFC complex |
| CORUM:266 | 3.41705576683e-05 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | RAD17-RFC complex |
| CORUM:2199 | 3.41705576683e-05 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | CHTF18-RFC2-5 complex |
| CORUM:2797 | 3.41705576683e-05 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | PCNA-CHL12-RFC2-5 complex |
| CORUM:2799 | 3.41705576683e-05 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | RFC complex |
| CORUM:2202 | 3.41705576683e-05 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | CHTF18-RFC2-5 complex |
| CORUM:2810 | 3.41705576683e-05 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | RAD17-RFC complex |
| CORUM:2203 | 5.12534978153e-05 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | BRD4-RFC complex |
| CORUM:2804 | 7.17516227795e-05 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | CTF18-cohesion-RFC complex |
| CORUM:1003 | 9.56644648234e-05 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | RC complex (Replication competent complex) |
| CORUM:274 | 9.56644648234e-05 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | 9-1-1-RAD17-RFC complex |
| CORUM:268 | 9.56644648234e-05 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | 9-1-1-RAD17-RFC complex |
| CORUM:3070 | 9.56644648234e-05 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | CTF18-cohesion-RFC-POLH complex |
| KEGG:03430 | 0.000192947765955 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Mismatch repair |
| WP:WP531 | 0.000286309588192 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | DNA mismatch repair |
| KEGG:03030 | 0.000480177590636 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | DNA replication |
| REAC:R-HSA-69091 | 0.000620139908703 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Polymerase switching |
| REAC:R-HSA-69109 | 0.000620139908703 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Leading Strand Synthesis |
| KEGG:03410 | 0.000688034410789 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Base excision repair |
| REAC:R-HSA-110312 | 0.000817692256233 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Translesion synthesis by REV1 |
| REAC:R-HSA-5656121 | 0.000817692256233 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Translesion synthesis by POLI |
| REAC:R-HSA-5655862 | 0.000926675585137 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Translesion synthesis by POLK |
| WP:WP466 | 0.000973512535349 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | DNA replication |
| WP:WP4753 | 0.00102095428698 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Nucleotide excision repair |
| REAC:R-HSA-110320 | 0.0011650518872 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Translesion Synthesis by POLH |
| KEGG:03420 | 0.00125862804941 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Nucleotide excision repair |
| REAC:R-HSA-69186 | 0.00129444299395 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Lagging Strand Synthesis |
| REAC:R-HSA-5651801 | 0.00143063482691 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | PCNA-Dependent Long Patch Base Excision Repair |
| REAC:R-HSA-5696397 | 0.00204339075673 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Gap-filling DNA repair synthesis and ligation in GG-NER |
| REAC:R-HSA-110373 | 0.00204339075673 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Resolution of AP sites via the multiple-nucleotide patch replacement pathway |
| REAC:R-HSA-174411 | 0.00221357222266 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Polymerase switching on the C-strand of the telomere |
| REAC:R-HSA-110314 | 0.00296224002415 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Recognition of DNA damage by PCNA-containing replication complex |
| WP:WP5114 | 0.00296720799434 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Nucleotide excision repair in xeroderma pigmentosum |
| REAC:R-HSA-5656169 | 0.00316638779295 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Termination of translesion DNA synthesis |
| REAC:R-HSA-69190 | 0.0033773260227 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | DNA strand elongation |
| REAC:R-HSA-9709570 | 0.00381957013228 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Impaired BRCA2 binding to RAD51 |
| REAC:R-HSA-174417 | 0.00381957013228 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Telomere C-strand (Lagging Strand) Synthesis |
| REAC:R-HSA-73933 | 0.00405087414568 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Resolution of Abasic Sites (AP sites) |
| REAC:R-HSA-5685938 | 0.00405087414568 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | HDR through Single Strand Annealing (SSA) |
| WP:WP2446 | 0.00412431213363 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Retinoblastoma gene in cancer |
| GO:0031391 | 0.00421361424067 | 0.666666666667 | ATAD5 RFC4 | Elg1 RFC-like complex |
| REAC:R-HSA-176187 | 0.00428896488724 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Activation of ATR in response to replication stress |
| REAC:R-HSA-110313 | 0.00478550282195 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Translesion synthesis by Y family DNA polymerases bypasses lesions on DNA template |
| REAC:R-HSA-5693616 | 0.00504394814871 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Presynaptic phase of homologous DNA pairing and strand exchange |
| REAC:R-HSA-9675136 | 0.00530917647079 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Diseases of DNA Double-Strand Break Repair |
| REAC:R-HSA-9701190 | 0.00530917647079 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Defective homologous recombination repair (HRR) due to BRCA2 loss of function |
| REAC:R-HSA-5696400 | 0.005581186855 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Dual Incision in GG-NER |
| REAC:R-HSA-5693579 | 0.00585997836812 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Homologous DNA Pairing and Strand Exchange |
| WP:WP4946 | 0.0071317033437 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | DNA repair pathways full network |
| REAC:R-HSA-73893 | 0.00735562020533 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | DNA Damage Bypass |
| REAC:R-HSA-9675135 | 0.00800131218049 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Diseases of DNA repair |
| REAC:R-HSA-180786 | 0.00867409880878 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Extension of Telomeres |
| GO:0008094 | 0.0120707547584 | 1.0 | ATAD5 RFC5 RFC4 | ATP-dependent activity, acting on DNA |
| REAC:R-HSA-6782210 | 0.0132793882188 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Gap-filling DNA repair synthesis and ligation in TC-NER |
| REAC:R-HSA-6782135 | 0.0137071284674 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Dual incision in TC-NER |
| GO:0005663 | 0.0140440992017 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | DNA replication factor C complex |
| REAC:R-HSA-5685942 | 0.0145828870271 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | HDR through Homologous Recombination (HRR) |
| GO:0006275 | 0.0146194737676 | 1.0 | ATAD5 RFC5 RFC4 | regulation of DNA replication |
| REAC:R-HSA-73884 | 0.0193669984414 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Base Excision Repair |
| REAC:R-HSA-6781827 | 0.019882541548 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Transcription-Coupled Nucleotide Excision Repair (TC-NER) |
| REAC:R-HSA-5696399 | 0.0231174657298 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Global Genome Nucleotide Excision Repair (GG-NER) |
| CORUM:1132 | 0.0249718442456 | 0.333333333333 | RFC4 | RFC2-RIalpha complex |
| REAC:R-HSA-69473 | 0.0254089329805 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | G2/M DNA damage checkpoint |
| REAC:R-HSA-6804756 | 0.0265950995478 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Regulation of TP53 Activity through Phosphorylation |
| REAC:R-HSA-5693607 | 0.0271982878007 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Processing of DNA double-strand break ends |
| REAC:R-HSA-157579 | 0.0336004634561 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Telomere Maintenance |
| REAC:R-HSA-5696398 | 0.0392065258044 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Nucleotide Excision Repair |
| GO:0031390 | 0.0393180950424 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Ctf18 RFC-like complex |
| GO:0003689 | 0.0393180950424 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | DNA clamp loader activity |
| REAC:R-HSA-69239 | 0.0476168581556 | 0.666666666667 | RFC5 RFC4 | Synthesis of DNA |
Edges
| Protein 1 | Protein 2 | Score | ProteomeHD | Evidence |
|---|---|---|---|---|
| RFC5 | RFC4 | 1.0 | 0.946 | hein_WMM bioplex3_HEK293 bioplex () bioplex_WMM Guru bioplex3_WMM youn_WMM Malo bioplex3_HCT116 gupta_WMM fraction treiber_WMM |
| ATAD5 | RFC5 | 0.998 | 0.206 | hein_WMM bioplex3_HEK293 bioplex () bioplex_WMM bioplex3_WMM youn_WMM |
| ATAD5 | RFC4 | 0.996 | 0.258 | hein_WMM bioplex3_HEK293 bioplex () bioplex_WMM bioplex3_WMM youn_WMM gupta_WMM |
Related Complexes