hu.MAP 3.0: Complex View
Human Protein Complex Map
Search for a protein
Complex: huMAP3_14857.1
Confidence: Medium
Proteins| Genename | Protein Name | Uniprot Annotation Score | Links |
|---|---|---|---|
| IFFO2 | Intermediate filament family orphan 2 | 2 | UniProt NCBI |
| LIG4 | DNA ligase 4 (EC 6.5.1.1) (DNA ligase IV) (Polydeoxyribonucleotide synthase [ATP] 4) | 5 | UniProt NCBI |
| XRCC4 | DNA repair protein XRCC4 (hXRCC4) (X-ray repair cross-complementing protein 4) [Cleaved into: Protein XRCC4, C-terminus (XRCC4/C)] | 5 | UniProt NCBI |
Enrichments
| Term ID | Corrected Pval | Fraction Complex Coverage | Proteins | Term Name |
|---|---|---|---|---|
| CORUM:345 | 3.41752350426e-06 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | DNA ligase IV-XRCC4 complex |
| CORUM:348 | 3.41752350426e-06 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | DNA ligase IV-XRCC4 complex |
| CORUM:354 | 3.41752350426e-06 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | DNA ligase IV-XRCC4 complex |
| CORUM:344 | 3.41752350426e-06 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | DNA ligase IV-XRCC4 complex |
| CORUM:359 | 3.41752350426e-06 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | DNA ligase IV-XRCC4-XLF complex |
| CORUM:206 | 3.41752350426e-06 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | DNA ligase IV-XRCC4 complex |
| CORUM:352 | 3.41752350426e-06 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | DNA ligase IV-XRCC4 complex |
| CORUM:350 | 1.02521027753e-05 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | DNA ligase IV-XRCC4-PNK complex |
| CORUM:336 | 1.02521027753e-05 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | DNA ligase IV-XRCC4-AHNK complex |
| CORUM:1189 | 3.41705576683e-05 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | DNA double-strand break end-joining complex |
| WP:WP438 | 4.07657496791e-05 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | Non homologous end joining |
| KEGG:03450 | 4.19681517392e-05 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | Non-homologous end-joining |
| REAC:R-HSA-164843 | 0.000143154936711 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | 2-LTR circle formation |
| REAC:R-HSA-162592 | 0.00024538606603 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | Integration of provirus |
| REAC:R-HSA-162594 | 0.000531572756485 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | Early Phase of HIV Life Cycle |
| GO:0032807 | 0.00140460216025 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | DNA ligase IV complex |
| HP:0000320 | 0.00171977631115 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | Bird-like facies |
| HP:0004430 | 0.00193466002352 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | Severe combined immunodeficiency |
| HP:0005387 | 0.00626783027637 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | Combined immunodeficiency |
| WP:WP4946 | 0.0071317033437 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | DNA repair pathways full network |
| WP:WP4673 | 0.00777794899874 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | Male infertility |
| GO:0051103 | 0.00842684400117 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | DNA ligation involved in DNA repair |
| REAC:R-HSA-5693571 | 0.01244419045 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | Nonhomologous End-Joining (NHEJ) |
| GO:0033152 | 0.0140440992017 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | immunoglobulin V(D)J recombination |
| HP:0003220 | 0.0167410266547 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | Abnormality of chromosome stability |
| HP:0004422 | 0.0201452261528 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | Biparietal narrowing |
| GO:0005958 | 0.0210651876021 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | DNA-dependent protein kinase-DNA ligase 4 complex |
| CORUM:213 | 0.0249718442456 | 0.333333333333 | LIG4 | DNA ligase IV-XRCC1 complex |
| HP:0100585 | 0.0304647837379 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | Telangiectasia of the skin |
| HP:0000444 | 0.0388502441646 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | Convex nasal ridge |
| GO:0033151 | 0.0393180950424 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | V(D)J recombination |
| GO:0070419 | 0.0393180950424 | 0.666666666667 | XRCC4 LIG4 | nonhomologous end joining complex |
Edges
| Protein 1 | Protein 2 | Score | ProteomeHD | Evidence |
|---|---|---|---|---|
| XRCC4 | LIG4 | 0.999 | 0.18 | hein_WMM bioplex3_HEK293 bioplex () bioplex_WMM bioplex3_WMM bioplex3_HCT116 |
| XRCC4 | IFFO2 | 0.999 | bioplex3_HEK293 bioplex () bioplex_WMM bioplex3_WMM bioplex3_HCT116 | |
| IFFO2 | LIG4 | 0.931 | bioplex_WMM bioplex3_WMM WMM_only |
Related Complexes